以下，リモート側（スパコン）の設定の話

数字を値として判断してくれる便利なdiff． 絶対差や相対差が指定でき，その差の中に収まっていれば同一とみなしてくれる．

スパコンに numdiff は入っていないので取ってくる必要がある．

http://www.nongnu.org/numdiff/

tar xzvf numdiff-5.8.1.tar.gz 
cd numdiff-5.8.1
./configure --prefix=$HOME

デフォルトだとコンパイラがiccになっているが，iccのままmakeするとときどきabortするnumdiffが出来上がったので， 特別な理由がなければgccに変えた方が良いかも． Makefile のファイルを以下のように修正．

CC=gcc

その後は，makeしてインストールする．

make
make install

すると，$HOME/bin/numdiff の出来上がり．

履歴を共有する．

export HISTCONTROL=ignoredups:erasedups  # no duplicate entries
export HISTSIZE=100000                   # big big history
export HISTFILESIZE=100000               # big big history
shopt -s histappend                      # append to history, don't overwrite it
 
 
# Save and reload the history after each command finishes
export PROMPT_COMMAND="history -a; history -c; history -r; $PROMPT_COMMAND"

以下，ローカル（手元のパソコン）の設定

debinaでnvidiaのドライバを入れていたらglx関係で動かないアプリケーションがある． こんなエラーが出る．

X Error: GLXBadContext 140
  Extension:    155 (Uknown extension)
  Minor opcode: 5 (Unknown request)
  Resource id:  0x300068e
X Error: 0 0
  Extension:    143 (Uknown extension)
  Minor opcode: 26 (Unknown request)
  Resource id:  0x0

対策方法としてはiglxを利用するのだが，以下のように設定すると一応うまくいった．

まず，gdm3ではうまくいかなかったので，lightdmに切り替える．

sudo apt-get install lightdm

インストール時にgdm3とlightdmどっちと効かれるので，lightdmを選択する．

/usr/share/lightdm/lightdm.conf.d/50-xserver-command.conf を作成し，以下を記述

[SeatDefaults]
# Dump core
xserver-command=X -core +iglx

これでリブートしてログインしなおせば，OK． lightdmで window manager を選択するときは画面右上のプルダウンから選択する．

Exceed_onDemand_Clientでparaviewを使おうとすると，うまく行かないが， 普通にsshでXをフォワードするとうまく行った．

ssh s50206@laurel.kudpc.kyoto-u.ac.jp -X

してから，

module load paraview
paraview &

でOK.

デフォルトでは，手元のキーボードが英語キーボードでも入力が日本語キーボードになる． 英語キーボードにするには，Exceed onDemandでログインし，Xconfigの設定をするところで， メニューバーから 編集 ⇒ Xconfig Manger を選択 Passive.cfgをコピーし，適当な名前を付けて編集する． 編集するのはキーボードファイルでus.kbfに変更すれば英語キーボードで入力可能になる．

こんなエラーが出たら，

Exceed_onDemand_Client_8/eodxc: error while loading shared libraries: libgtk-x11-2.0.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
 
Exceed_onDemand_Client_8/eodxc: error while loading shared libraries: libpangoxft-1.0.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory

Exceed_onDemand_Client_8/eodxc: error while loading shared libraries: libpangox-1.0.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory

32bit版のパッケージを入れてあげる．

sudo dpkg --add-architecture i386
sudo apt-get update 
sudo apt-get install libgtk2.0-0:i386
sudo apt-get install libpangoxft-1.0-0:i386
sudo apt-get install libpangox-1.0-0:i386

パスワードは利用承認書に書いてあるもの． ログイン時に使うものではない．

tar.gzのファイル解凍後にeodxcが起動しない場合はローカル端末を再起動してもう一度eodxcを起動してみる．

aliasを用いて，任意のコマンドでExceed onDemandを開く方法 ~/.bashrc に以下を追記する．

alias eodxc='~/Exceed_onDemand_Client_8/eodxc' 

（Terminalを開き直し，）“eodxc”と打つと“~/Exceed_onDemand_Client_8/eodxc”を実行してくれるので，どこからでも起動可能で幸せ

まずFilezillaをインストールする．

sudo apt-get install filezilla

ローカルでfilezillaを立ち上げ、編集⇒設定⇒SFTPで鍵ファイルを追加する。

Filezillaで隠しフォルダを表示させたい時は、右クリックでチェックを入れる．

一度スパコンにログインしたことがあれば、.sshの下にid_rsaがあるはずなので、これを追加。

ファイル形式はppkに変換される。

ppkファイルの保存場所はどこでも良いが、.sshの下に置いておけば良いのではなかろうか。

公開鍵認証の追加を忘れない。

Filezillaを開き，［ファイル］→［サイトマネージャー］で新規サイトの名前をlaurelに変更する．そのサイトのホストに下記のものを打ち込む．

laurel.kudpc.kyoto-u.ac.jp

プロトコルはSFTP.ログオンの種類は通常．ユーザーは,b◯◯◯◯◯的なもの．パスワードは利用申請書に書いてあるもの．

mapleのXを使うときは、普通のssh -X では繋がらないらしい． emacs は 普通のsshで大丈夫。

Exceed on Demand をインストールする． http://web.kudpc.kyoto-u.ac.jp/manual/ja/install/eod

ローカルの端末でlaurelに接続

ssh b59999@laurel.kudpc.kyoto-u.ac.jp -L 5500:laurel.kudpc.kyoto-u.ac.jp:5500 -X

ローカルに別の端末を開き，eodを立ち上げる．

Exceed_onDemand_Client_8/eodxc 

接続の設定はこんな感じ．

host localhost
account b59999
passwd
Xstart Japanese_Gnome_Terminal.xs
Xconfig Passive.cfg 

エラーが出たらXstart,Xconfigをそれぞれもう一度選びなおすとよい．

alias eodxc='~/Exceed_onDemand_Client_8/eodxc'

としておけば幸せになれる．