差分

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--- kudpc [2014/09/29 15:23]
tsuji
+++ kudpc [2018/08/21 10:21] (現在)
saito [paraview]
@@ ライン 1: / ライン 1: @@
-====== bashrc ======
+====== Remote側 ======
+以下，リモート側（スパコン）の設定の話
+===== numdiff =====
+数字を値として判断してくれる便利なdiff．
+絶対差や相対差が指定でき，その差の中に収まっていれば同一とみなしてくれる．
+スパコンに numdiff は入っていないので取ってくる必要がある．
+[[http://www.nongnu.org/numdiff/]]
+<code bash>
+tar xzvf numdiff-5.8.1.tar.gz
+cd numdiff-5.8.1
+./configure --prefix=$HOME
+</code>
+デフォルトだとコンパイラがiccになっているが，iccのままmakeするとときどきabortするnumdiffが出来上がったので，
+特別な理由がなければgccに変えた方が良いかも．
+Makefile のファイルを以下のように修正．
+<code>
+CC=gcc
+</code>
+その後は，makeしてインストールする．
+<code bash>
+make
+make install
+</code>
+すると，$HOME/bin/numdiff の出来上がり．
+===== bashrc =====
 履歴を共有する．
 <code bash>
@@ ライン 11: / ライン 40: @@
 export PROMPT_COMMAND="history -a; history -c; history -r; $PROMPT_COMMAND"
 </code>
-====== Exceed onDemandを使う ======
- error while loading shared libraries: libgtk-x11-2.0.so.0 などとエラーが出たら下記を実行する．
+====== Local側 ======
+===== paraview(その1) =====
+以下，ローカル（手元のパソコン）の設定
+debinaでnvidiaのドライバを入れていたらglx関係で動かないアプリケーションがある．
+こんなエラーが出る．<code>
+X Error: GLXBadContext 140
+  Extension:    155 (Uknown extension)
+  Minor opcode: 5 (Unknown request)
+  Resource id:  0x300068e
+X Error: 0 0
+  Extension:    143 (Uknown extension)
+  Minor opcode: 26 (Unknown request)
+  Resource id:  0x0
+</code>
+対策方法としてはiglxを利用するのだが，以下のように設定すると一応うまくいった．
+まず，gdm3ではうまくいかなかったので，lightdmに切り替える．
+<code bash>
+sudo apt-get install lightdm
+</code>
+インストール時にgdm3とlightdmどっちと効かれるので，lightdmを選択する．
+/usr/share/lightdm/lightdm.conf.d/50-xserver-command.conf を作成し，以下を記述
+<code>
+[SeatDefaults]
+# Dump core
+xserver-command=X -core +iglx
+</code>
+これでリブートしてログインしなおせば，OK．
+lightdmで window manager を選択するときは画面右上のプルダウンから選択する．
+===== paraview(その2) =====
+Exceed_onDemand_Clientでparaviewを使おうとすると，うまく行かないが，
+普通にsshでXをフォワードするとうまく行った．
+<code bash>
+ssh s50206@laurel.kudpc.kyoto-u.ac.jp -X
+</code>
+してから，
+<code bash>
+module load paraview
+paraview &
+</code>
+でOK.
+===== WindowsのExceed onDemandで英語キーボードを使う =====
+デフォルトでは，手元のキーボードが英語キーボードでも入力が日本語キーボードになる．
+英語キーボードにするには，Exceed onDemandでログインし，Xconfigの設定をするところで，
+メニューバーから 編集 => Xconfig Manger を選択
+Passive.cfgをコピーし，適当な名前を付けて編集する．
+編集するのはキーボードファイルでus.kbfに変更すれば英語キーボードで入力可能になる．
+===== Exceed onDemandを使う =====
+こんなエラーが出たら，
+<code>
+Exceed_onDemand_Client_8/eodxc: error while loading shared libraries: libgtk-x11-2.0.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
+Exceed_onDemand_Client_8/eodxc: error while loading shared libraries: libpangoxft-1.0.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
+Exceed_onDemand_Client_8/eodxc: error while loading shared libraries: libpangox-1.0.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
+</code>
+bit版のパッケージを入れてあげる．
 <code bash>
 sudo dpkg --add-architecture i386
 sudo apt-get update
 sudo apt-get install libgtk2.0-0:i386
+sudo apt-get install libpangoxft-1.0-0:i386
+sudo apt-get install libpangox-1.0-0:i386
 </code>
@@ ライン 22: / ライン 118: @@
 ログイン時に使うものではない．
-====== Fillezillaを使う ======
+tar.gzのファイル解凍後にeodxcが起動しない場合はローカル端末を再起動してもう一度eodxcを起動してみる．
+===== aliasの使い方 ======
+aliasを用いて，任意のコマンドでExceed onDemandを開く方法
+~/.bashrc に以下を追記する．
+<code bash>
+alias eodxc='~/Exceed_onDemand_Client_8/eodxc' </code>
+（Terminalを開き直し，）"eodxc"と打つと"~/Exceed_onDemand_Client_8/eodxc"を実行してくれるので，どこからでも起動可能で幸せ
+===== Filezillaを使う =====
+まずFilezillaをインストールする．
+<code bash>
+sudo apt-get install filezilla
+</code>
 ローカルでfilezillaを立ち上げ、編集=>設定=>SFTPで鍵ファイルを追加する。
+Filezillaで隠しフォルダを表示させたい時は、右クリックでチェックを入れる．
 一度スパコンにログインしたことがあれば、.sshの下にid_rsaがあるはずなので、これを追加。
@@ ライン 33: / ライン 146: @@
 公開鍵認証の追加を忘れない。
-Filezillaで隠しフォルダを表示させたい時は、右クリックでOK。
+Filezillaを開き，［ファイル］→［サイトマネージャー］で新規サイトの名前をlaurelに変更する．そのサイトのホストに下記のものを打ち込む．
+<code bash>
+laurel.kudpc.kyoto-u.ac.jp
+</code>
+プロトコルはSFTP.ログオンの種類は通常．ユーザーは,b◯◯◯◯◯的なもの．パスワードは利用申請書に書いてあるもの．
-====== Xを使う ======
+===== Xを使う =====
 mapleのXを使うときは、普通のssh -X では繋がらないらしい．
 emacs は 普通のsshで大丈夫。
@@ ライン 60: / ライン 177: @@
 Xconfig Passive.cfg
 </code>
+エラーが出たらXstart,Xconfigをそれぞれもう一度選びなおすとよい．
 <code bash>
 alias eodxc='~/Exceed_onDemand_Client_8/eodxc'
 </code>
 としておけば幸せになれる．

Applied Mechanics wiki

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