http://accc.riken.jp/HPC/training/text.html
http://www.k.mei.titech.ac.jp/~stamura/NumericalComputation-Tips.html これくらいオプションをつけて実行すれば,だいたいエラーは検出されそう.
ifort -check all -warn declarations -CB -fpe0 -traceback
コンパイラオプションも参照のこと
デフォルトのスタックサイズが小さすぎて、-openmpをやるときはスタックサイズを増やしてあげないと、頻繁にセグ落ちする。
!$OMP parallel write(*,*) KMP_GET_STACKSIZE_S() !$OMP end parallel
とやると、各スレッドのスタックサイズを返す。これを増やす場合は、最初の!$OMPの前に、
CALL KMP_SET_STACKSIZE_S(size)
とやれば良い。sizeは整数型の変数。所望のスタックサイズ(byte)を書けばよい。
ifortでは出力時に勝手に改行する仕様になっている。 改行を抑制するためには、Format文を使用すればよい。
適当なやり方。
write(*,'(100f)') a(:)
きちんとしたやり方。以下2chより引用。
http://pc12.2ch.net/test/read.cgi/tech/1163319215/532
532 名前:デフォルトの名無しさん [sage]: 2009/03/27(金) 05:59:41 亀だけど、Ifortなら<>がお勧め。 多次元配列の最初の数を入れることが多いです 例 program main implicit none integer,parameter :: num = 9 integer :: ii,jj real :: arry(num,num) do ii=1,num do jj = 1,num arry(ii,jj) = ii*jj enddo enddo write(6,'(<num>F)') arry end program
pardisoはCSRフォーマットを用いるが,coordinateフォーマットから変換するサブルーチンが用意されている.
https://software.intel.com/en-us/node/468628
フォーマットについてはこちらから.
https://software.intel.com/en-us/node/471374
Fortranの場合,job(1:8)に与える数値は以下の通りで(だいたい)OK.
job(1)=1 | the matrix in the coordinate format is converted to the CSR format. |
job(2)=1 | one-based indexing for the matrix in CSR format is used. |
job(3)=1 | one-based indexing for the matrix in coordinate format is used. |
job(4) | 特に設定不要 |
job(5)=nnz | sets number of the non-zero elements of the matrix A if job(1)=1. |
job(6)=0 | all arrays acsr, ja, ia are filled in for the output storage. |
pardisoを用いた連立一時方程式の解き方.
スパコンの
/opt/app/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/examples/solverf/source/
に入っているサンプルデータを参考に,走らせたいプログラムを作成する. include文が大事. 自分のプログラムに
include 'mkl_pardiso.f77'
か
include 'mkl_pardiso.f90'
を入れる.
配列の設定に注意が必要,詳しくは以下を参照 [http://www.pardiso-project.org/manual/manual.pdf]
コンパイラオプションは
-mkl
でお手軽♪