====== Remote側 ======
以下，リモート側（スパコン）の設定の話

===== numdiff =====
数字を値として判断してくれる便利なdiff．
絶対差や相対差が指定でき，その差の中に収まっていれば同一とみなしてくれる．

スパコンに numdiff は入っていないので取ってくる必要がある．

[[http://www.nongnu.org/numdiff/]]
<code bash>
tar xzvf numdiff-5.8.1.tar.gz 
cd numdiff-5.8.1
./configure --prefix=$HOME
</code>

デフォルトだとコンパイラがiccになっているが，iccのままmakeするとときどきabortするnumdiffが出来上がったので，
特別な理由がなければgccに変えた方が良いかも．
Makefile のファイルを以下のように修正．
<code>
CC=gcc
</code>
その後は，makeしてインストールする．
<code bash>
make
make install
</code>
すると，$HOME/bin/numdiff の出来上がり．

===== bashrc =====
履歴を共有する．
<code bash>
export HISTCONTROL=ignoredups:erasedups  # no duplicate entries
export HISTSIZE=100000                   # big big history
export HISTFILESIZE=100000               # big big history
shopt -s histappend                      # append to history, don't overwrite it


# Save and reload the history after each command finishes
export PROMPT_COMMAND="history -a; history -c; history -r; $PROMPT_COMMAND"
</code>

====== Local側 ======
===== paraview(その1) =====

以下，ローカル（手元のパソコン）の設定

debinaでnvidiaのドライバを入れていたらglx関係で動かないアプリケーションがある．
こんなエラーが出る．<code>
X Error: GLXBadContext 140
  Extension:    155 (Uknown extension)
  Minor opcode: 5 (Unknown request)
  Resource id:  0x300068e
X Error: 0 0
  Extension:    143 (Uknown extension)
  Minor opcode: 26 (Unknown request)
  Resource id:  0x0
</code>

対策方法としてはiglxを利用するのだが，以下のように設定すると一応うまくいった．

まず，gdm3ではうまくいかなかったので，lightdmに切り替える．
<code bash>
sudo apt-get install lightdm
</code>
インストール時にgdm3とlightdmどっちと効かれるので，lightdmを選択する．

/usr/share/lightdm/lightdm.conf.d/50-xserver-command.conf を作成し，以下を記述
<code>
[SeatDefaults]
# Dump core
xserver-command=X -core +iglx
</code>

これでリブートしてログインしなおせば，OK．
lightdmで window manager を選択するときは画面右上のプルダウンから選択する．


===== paraview(その2) =====
Exceed_onDemand_Clientでparaviewを使おうとすると，うまく行かないが，
普通にsshでXをフォワードするとうまく行った．
<code bash>
ssh s50206@laurel.kudpc.kyoto-u.ac.jp -X
</code> 
してから，
<code bash>
module load paraview
paraview &
</code>
でOK.

===== WindowsのExceed onDemandで英語キーボードを使う =====
デフォルトでは，手元のキーボードが英語キーボードでも入力が日本語キーボードになる．
英語キーボードにするには，Exceed onDemandでログインし，Xconfigの設定をするところで，
メニューバーから 編集 => Xconfig Manger を選択
Passive.cfgをコピーし，適当な名前を付けて編集する．
編集するのはキーボードファイルでus.kbfに変更すれば英語キーボードで入力可能になる．

===== Exceed onDemandを使う =====
こんなエラーが出たら，
<code>
Exceed_onDemand_Client_8/eodxc: error while loading shared libraries: libgtk-x11-2.0.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
 
Exceed_onDemand_Client_8/eodxc: error while loading shared libraries: libpangoxft-1.0.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory

Exceed_onDemand_Client_8/eodxc: error while loading shared libraries: libpangox-1.0.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
</code>
32bit版のパッケージを入れてあげる．
<code bash>
sudo dpkg --add-architecture i386
sudo apt-get update 
sudo apt-get install libgtk2.0-0:i386
sudo apt-get install libpangoxft-1.0-0:i386
sudo apt-get install libpangox-1.0-0:i386
</code>

パスワードは利用承認書に書いてあるもの．
ログイン時に使うものではない．

tar.gzのファイル解凍後にeodxcが起動しない場合はローカル端末を再起動してもう一度eodxcを起動してみる．

===== aliasの使い方 ======
aliasを用いて，任意のコマンドでExceed onDemandを開く方法
~/.bashrc に以下を追記する．
<code bash>
alias eodxc='~/Exceed_onDemand_Client_8/eodxc' </code>

（Terminalを開き直し，）"eodxc"と打つと"~/Exceed_onDemand_Client_8/eodxc"を実行してくれるので，どこからでも起動可能で幸せ

===== Filezillaを使う =====
まずFilezillaをインストールする．
<code bash>
sudo apt-get install filezilla
</code>

ローカルでfilezillaを立ち上げ、編集=>設定=>SFTPで鍵ファイルを追加する。

Filezillaで隠しフォルダを表示させたい時は、右クリックでチェックを入れる．

一度スパコンにログインしたことがあれば、.sshの下にid_rsaがあるはずなので、これを追加。

ファイル形式はppkに変換される。

ppkファイルの保存場所はどこでも良いが、.sshの下に置いておけば良いのではなかろうか。

公開鍵認証の追加を忘れない。

Filezillaを開き，［ファイル］→［サイトマネージャー］で新規サイトの名前をlaurelに変更する．そのサイトのホストに下記のものを打ち込む．
<code bash>
laurel.kudpc.kyoto-u.ac.jp
</code>
プロトコルはSFTP.ログオンの種類は通常．ユーザーは,b◯◯◯◯◯的なもの．パスワードは利用申請書に書いてあるもの．

===== Xを使う =====
mapleのXを使うときは、普通のssh -X では繋がらないらしい．
emacs は 普通のsshで大丈夫。

Exceed on Demand をインストールする．
http://web.kudpc.kyoto-u.ac.jp/manual/ja/install/eod

ローカルの端末でlaurelに接続
<code bash>
ssh b59999@laurel.kudpc.kyoto-u.ac.jp -L 5500:laurel.kudpc.kyoto-u.ac.jp:5500 -X
</code>

ローカルに別の端末を開き，eodを立ち上げる．
<code>
Exceed_onDemand_Client_8/eodxc 
</code>

接続の設定はこんな感じ．
<code>
host localhost
account b59999
passwd
Xstart Japanese_Gnome_Terminal.xs
Xconfig Passive.cfg 
</code>
エラーが出たらXstart,Xconfigをそれぞれもう一度選びなおすとよい．
<code bash>
alias eodxc='~/Exceed_onDemand_Client_8/eodxc'
</code>
としておけば幸せになれる．